Станцыя забяспечвала больш за палову патрэбнасці ў электрычнасці Літвы, а таксама дапамагала развіваць эканоміку ўжо незалежнай Літоўскай Рэспублікі пасля распаду Савецкага Саюза.
Ва ўгоду палітычным амбіцыям, звязаным з уступленнем у ЕС, улады краіны вырашылі зачыніць электрастанцыю - першы яе блок спынілі ў 2004 годзе, другі - у 2009-м. У цяперашні час на Ігналінскай АЭС вядуцца дэмантажныя працы.